《神雕侠侣》主要是以杨过与小龙女的爱情为主线的，中间虽然掺杂着国仇家恨，但是人们也多为欣赏他们二人之间生死相依的爱恋。
小龙女与杨过为名义上的师徒。但是杨过却仰慕自己的姑姑小龙女。二人最终决定不顾世俗的眼光在一起一辈子。但是这中间出现了很多的小插曲，让他们的爱情故事变得一波三折。杨过要与小龙女在一起，首先站出来反对的就是郭靖。
郭靖本与杨过之父杨康是好兄弟，但是杨康认贼作父，二人反目，杨康又作茧自缚，死在了黄蓉穿的软猬甲的剧毒上。但是他们对杨康之子杨过有养育爱护之心。所以，杨过虽然想要为父报仇，却也难以下手。而郭靖一心想把郭芙嫁给杨过为妻，还为此逼走了小龙女。不过，郭芙却砍下了杨过的一只手臂，二人婚事作罢。
小龙女与杨过中了情花之毒，后来小龙女跳崖，而杨过被黄蓉哄骗，为了十六年后能与夫人相见，服下了情花毒的解药断肠草。这十六年杨过就出现了一个感情空档期。小龙女不知所踪，杨过虽然一直在找，但是却没有一点消息。
而郭靖的二女儿郭襄与杨过初次见面是刚出生的时候，郭襄被李莫愁抢走，杨过为救下郭襄，一路跟随李莫愁，二人一并养育过郭襄一段时间。所以，郭襄与杨过之间相差二十多岁，杨过对她的感情只可能是“长辈对子女的感情”，毕竟在古代那个年纪的男子都已经有了自己的孩子。所以虽然郭襄是杨过的妹妹，但是杨过对她的宠爱已然是把她当成了小女儿一般。
杨过救了郭襄，又给了她三根银针，答应她三个愿望，尽最大的努力去帮郭襄过生日等，杨过知道郭襄喜欢他，但是却不知道喜欢的如此深切。他觉得自己已经三十多岁的人了，郭襄刚十几岁，正是感情懵懂的时候。一时喜欢上了救自己的英雄，也是情有可原的，所以他虽然强调了自己在找妻子，却并没有明确拒绝郭襄。
杨过对郭襄所有的好都建立在他把郭襄当妹妹，甚至当女儿来看待宠爱，而非掺杂有男女感情。他一心喜爱的都只有姑姑小龙女。
